Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKD2Q9BZL6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms