Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms