Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2A3Q93084 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms