Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA3Q8TBC4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms