Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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