Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIEQ8NEW7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms