Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms