Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS8Q8N3P4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS8Q8N3P4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms