Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTE2Q6XPS3 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTE2Q6XPS3 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms