Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDZK1Q5T2W1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDZK1Q5T2W1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDZK1Q5T2W1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDZK1Q5T2W1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDZK1Q5T2W1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDZK1Q5T2W1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDZK1Q5T2W1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDZK1Q5T2W1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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