Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RFTN2Q52LD8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms