Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP13-3Q3SY46 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms