Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS72Q15906 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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