Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms