Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms