Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PCOLCEQ15113 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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