Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms