Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPVD1Q14C86 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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