Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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