Protein–RNA interactions for Protein: Q14766

LTBP1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1Q14766 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBP1Q14766 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBP1Q14766 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms