Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNB1Q14721 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms