Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMC2Q13753 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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