Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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