Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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