Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 KIZ-AS1-202ENST00000443753 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AMN1-212ENST00000542781 879 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC011726.1-201ENST00000515686 669 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms