Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms