Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TROQ12816 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TROQ12816 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TROQ12816 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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