Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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