Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM27E3Q08E93 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM27E3Q08E93 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms