Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms