Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms