Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms