Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms