Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms