Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CABP4P57796 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CABP4P57796 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CABP4P57796 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms