Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CRIP1P50238 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms