Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIA2P42262 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA2P42262 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA2P42262 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms