Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ARL3P36405 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms