Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms