Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5DP30049 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms