Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms