Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTGFP29279 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTGFP29279 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms