Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms