Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGAM1P18669 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGAM1P18669 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms