Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA1P17302 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GJA1P17302 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA1P17302 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA1P17302 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA1P17302 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA1P17302 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA1P17302 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms