Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 407.5 ms