Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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