Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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