Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGAP02671 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGAP02671 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGAP02671 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGAP02671 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGAP02671 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGAP02671 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGAP02671 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGAP02671 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGAP02671 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms