Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

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Length 610 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLGNO14967 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLGNO14967 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLGNO14967 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLGNO14967 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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